| 单位名称 | 单位性质 | 单位地址 | 主要职能 |
| 作物研究所 | 全额拨款事业单位 | 成都市狮子山路4号 | 农作物遗传育种、耕作栽培等研究与应用 |
| 植物保护研究所 | 全额拨款事业单位 | 成都市净居寺路20号 | 农作物病、虫、草、鼠防控技术及品种抗性评价等 |
| 生物技术核技术研究所 | 全额拨款事业单位 | 成都市狮子山路106号 | 农业生物技术、核技术、农化技术等研究与应用 |
| 遥感应用研究所 | 全额拨款事业单位 | 成都市净居寺路20号 | 土地资源调查及农作物的生长监测与评估 |
| 农业信息与农村经济研究所 | 全额拨款事业单位 | 成都市净居寺路20号 | 农业咨询、信息资源建设与网络服务及农村经济研究 |
| 茶叶研究所 | 全额拨款事业单位 | 成都市净居寺路20号 | 茶学科研及应用 |
| 农产品加工研究所 | 全额拨款事业单位 | 成都市狮子山路4号 | 农产品加工、农业科研基地管理及服务 |
| 服务中心 | 全额拨款事业单位 | 成都市净居寺路20号 | 后勤、幼儿教育等服务 |
| 水稻高粱研究所 | 全额拨款事业单位 | 泸州市大驿坝4号 | 水稻、高粱良种良法研究及其推广应用 |
| 经济作物育种栽培研究所 | 全额拨款事业单位 | 简阳市建设西路21号 | 棉、蔬、药材等作物品种选育、栽培、植保研究 |
| 蚕业研究所 | 全额拨款事业单位 | 南充市仪凤街108号 | 蚕桑、牧草研究及综合应用 |
| 院机关监察审计处 | 全额拨款事业单位 | 成都市净居寺路20号 | 负责全院的党风、党纪、监督、检查和行政监察审计 |
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